Autodesk - stvořte cokoliv - Genetic Constructor

Ne nadarmo se firma Autodesk prezentuje přídomkem "Make Anything", "Stvořte cokoliv". Její produkty jsou díky nápaditým tvůrcům přítomny v procesu tvorby většiny výrobků kolem nás, pozemních a inženýrských staveb, strojů a nástrojů, dopravních prostředků, továren, her či uměleckých děl. Nově ale můžete navrhovat a vyrábět i živé věci. Nevěříte?

Divize BioNano Research si již několik let zabývá vývojem CAD nástrojů pro biologii a nanotechnologie. Známá je například aplikace Molecule Viewer založená na stejné technologii jako prohlížeč 3D CAD dat A360 Viewer. Autodesk BioNano nyní uvolnil nový nástroj pro genetické inženýrství - Genetic Constructor. Genetic Constructor je cloudová CAD aplikace pro biologické navrhování a genetické inženýrství. Plazmidy a lineární dvouvlákna DNA vašich organismů můžete vytvářet v okně vašeho web browseru. Genetické návrhy lze tvořit zároveň na úrovni DNA sekvencí i na vyšších úrovních abstrakce. Výsledné návrhy lze integrovat s reálnými výrobními systémy DNA a doslova je tak uvést do života.

Genetic Constructor umí pracovat s online databázemi genů - oblíbené geny z knihoven NCBI a iGEM tak máte kdykoliv po ruce a můžete je přetáhnout myší do hierarchické struktury vámi navrhovaných sekvencí.

Chcete si ověřit knihovnu eukaryotických promotorů? Constructor vám vytvoří kombinatorickou knihovnu všech možných kombinací promotoru s vaším genem a ihned tak máte po ruce všechny možné kombinace sekvencí.

Podle amerického úřadu práce bude 65 % dnešních studentů zaměstnáno v profesích, které dnes ještě ani neexistují. Takže na otázku Čím chceš být, synku, až budeš velký? můžete dnes již dostat odpověď Matičko, chci být konstruktér. Genetický konstruktér.


Co je Genetic Constructor - představení aplikace:


Vyzkoušejte si Genetic Constructor sami na:
geneticconstructor.com
(stejně jako ostatní aplikace Autodesku je i Genetic Constructor pro akademickou sféru k dispozici zdarma)


Budoucnost vytváření věcí kolem nás - stvořte cokoliv


Make Anything

Překvapivá akvizice - Autodesk kupuje designérské studio The Living

Newyorské designérské studio "The Living" vedené Davidem Benjaminem se zaměřuje na avantgardní projekty a objekty z materiálů tvořených živými organismy a přírodními strukturami, na 3D tisk bakteriálních forem a na propojení různých bio-technologií.

Autodesk plánuje vytvořit s The Living společné Autodesk Studio a využívat CAD pro tvorbu nových typů projektů využívajících nové materiály, tvary a metodiky. Na pomezí kultury designu, CAD technologií, 3D tisku, robotiky, programování a biologie se pohybuje nejen The Living ale i sám Autodesk. K jeho méně známým aktivitám patří například Project Cyborg a výzkum bio- a nanotechnologií, programovatelné hmoty - viz autodeskresearch.com.

Studio The Living zvítězilo v nedávné soutěži mladých architektů s experimentálním projektem biologické architektury, budovy "Hy-Fi" - houbové věže tvořené živými cihlami z hub (viz obrázek). Pozornost vzbudil i projekt "Mussel Choir" (chór škeblí), ve kterém tvořily škeble bio-senzory zjišťující kvalitu vody a změny kvality se projevovaly zvukově, "zpěvem" celé instalace.

Více na In the Fold

Autodesk Project Cyborg - CAD pro nanosvět

Aktivity výzkumného oddělení Autodesku ("Autodesk Research") už delší dobu zasahují vedle "technických" CAD technologií i do oblasti biotechnologií a molekulární biologie. Pro tuto oblast již Autodesk má i několik zajímavých produktů - viz např. Sci-Viz, 3D tisk živých tkání, apod.

Podle příspěvku na blogu New York Times nyní Autodesk vstoupí oficiálně do světa biologie uvedením "Projektu Cyborg" - webové platformy pro molekulární modelování a simulaci. Project Cyborg bude představen na probíhající konferenci TED v Long Beach. Tento projekt je vyvíjen již dva roky a představuje spolupráci vývojářů CAD software s molekulárními biology. Vědci, ale i studenti a odborná veřejnost mají mít možnost využívat tento nástroj pro individuální projekty.

Díky novým nástrojům, jako jsou například 3D biotiskárny společnosti Organovo, se přibližuje svět "konstruování" či "digitálního prototypování" strojů a biologických živých materiálů. Oba tyto světy mají řadu společných rysů a procesy navrhování biologických materiálů se dnes již čím dál méně odlišují od navrhování automobilů nebo továren.

Každopádně Autodesk vykročil směrem, který otevírá široké možnosti budoucího vývoje.

Autodesk v biologii - Project Sci-Viz

Firma Autodesk je aktivní i v oblastech, které zdánlivě nesouvisí s jejími "primárními" obory CAD, GIS nebo médií a zábavy. Nejnovější aktivitou v tomto směru je "Project Sci-Viz" - vědecký vizualizační nástroj pro obor biologie. Není to její první aktivita v podobných oborech. Již v roce 1990 vytvořil Autodesk společný podnik s firmou Hypercube, kde vyvíjel a prodával nástroj pro modelování chemických sloučenin "HyperChem" (v CAD Studiu jsme jej v té době prodávali také v Československu). V roce 1994 se vývoj HyperChemu oddělil zpět do Hypercube, kde pokračuje dodnes.

Project Sci-Viz je doplněk do Autodesk 3ds Max. Autodesk Labs vyvinuly API a jádro Python umožňující běh nástrojů z dílen Olson Molecular Graphics Laboratory a UCSF v prostředí 3ds Max. Nástroje "embedded Python Molecular Viewer" (ePMV), AutoPack a CellPack tak mohou pracovat přímo v prostředí 64bitové verze 3ds Max 2013.

nukleokapsida HIV (Mark Yeager)

AutoPack je nástroj pro vyskládání různých typů tvarů do zadaného objemu nebo na zadaný povrch (mimochodem jeho uplatnění může být širší než jen biologie). Na něm je pak postaven nástroj CellPack umožňující tvořit podle zadaných předpisů biologické materiály a poskládat je do realistických molekulárních modelů v prostředí 3ds Max. "Molekulární prohlížeč" (ePMV) je doplněk 3ds Max umožňující snadný import molekulární geometrie z různých zdrojů, např. z Proteinové databáze (Protein Data Bank).

Více o Project Sci-Viz a stažení tohoto "technology preview" (expiruje 1.3.2013).